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Echoes of ancient introgression punctuate stable genomic lineages in the evolution of figs
Gardner. (2023). Proc Natl Acad Sci U S A.
Antiaris toxicaria Mesogyne insignis Poulsenia armata Castilla ulei Castilla elastica Castilla tunu Perebea mollis Perebea rubra Perebea guianensis subsp. guianensis Pseudolmedia laevigata Pseudolmedia laevis Pseudolmedia rigida Pseudolmedia spuria Perebea humilis Perebea angustifolia Perebea xanthochyma Perebea guianensis subsp. hirsuta Helicostylis turbinata Helicostylis tomentosa Helicostylis tovarensis Maquira guianensis subsp. costaricana Maquira guianensis Maquira sclerophylla Maquira coriacea Naucleopsis ternstroemiiflora Naucleopsis glabra Naucleopsis caloneura Naucleopsis macrophylla Naucleopsis ulei subsp. amara Naucleopsis krukovii Naucleopsis naga Naucleopsis francisci Naucleopsis capirensis Naucleopsis pseudonaga Olmedia aspera Antiaropsis decipiens Sparattosyce dioica Streblus asper Streblus tonkinensis Ficus assimilis Ficus variifolia Ficus magnoliifolia Ficus nervosa subsp. pubinervis Ficus racemigera Ficus nitidifolia Ficus austrocaledonica Ficus otophora Ficus webbiana Ficus asperula Ficus cf. crescentioides EG-2023 Ficus sp. Gardner 526 Ficus vasculosa Ficus callosa Ficus tsiangii Ficus cyrtophylla Ficus heterophylla Ficus henryi Ficus tinctoria Ficus virgata Ficus midotis Ficus subulata Ficus aurita Ficus hemsleyana Ficus uniglandulosa Ficus obscura Ficus sinuata Ficus pisifera Ficus scaberrima Ficus heteropleura Ficus rubrocuspidata Ficus parietalis Ficus brachyclada Ficus politoria Ficus pachyclada Ficus lateriflora Ficus ampelas Ficus fiskei Ficus melinocarpa Ficus asperifolia Ficus exasperata Ficus aff. conocephalifolia EG-2023 Ficus wassa Ficus copiosa Ficus montana Ficus palmata Ficus carica Ficus tikoua Ficus semicordata Ficus oligodon Ficus auriculata Ficus racemosa Ficus mucuso Ficus vogeliana Ficus sur Ficus tiliifolia Ficus torrentium Ficus mauritiana Ficus_variegata_Blume,_1825 Ficus microdictya Ficus dammaropsis Ficus austrina Ficus pseudopalma Ficus francisci Ficus albomaculata Ficus cereicarpa Ficus macrostyla Ficus pungens Ficus treubii Ficus hispida Ficus squamosa Ficus tarennifolia Ficus scortechinii Ficus fistulosa Ficus rosulata Ficus congesta Ficus lepicarpa Ficus nota Ficus septica Ficus botryocarpa Ficus bukitrayaensis Ficus beccarii Ficus bukitrayaensis Ficus malayana Ficus megaleia Ficus bukitrayaensis Ficus stolonifera Ficus pubigera Ficus dinganensis Ficus sarmentosa var. thunbergii Ficus pumila Ficus guizhouensis Ficus sarmentosa var. sarmentosa Ficus anserina Ficus excavata Ficus punctata Ficus carrii Ficus barba-jovis Ficus sarawakensis Ficus scratchleyana Ficus apiocarpa Ficus trichocarpa Ficus spiralis Ficus urnigera Ficus recurva Ficus villosa Ficus sagittata Ficus deltoidea Ficus heteromorpha Ficus gasparriniana Ficus chapaensis Ficus vaccinioides Ficus erecta var. beecheyana Ficus formosana Ficus ischnopoda Ficus laevis Ficus lamponga Ficus glandulifera Ficus chartacea Ficus hirta Ficus esquiroliana Ficus grossularioides Ficus fulva Ficus ruficaulis Ficus androchaete Ficus aurata Ficus brunneoaurata Ficus bruneiensis Ficus inaequipetiolata Ficus macilenta Ficus petiolaris Ficus americana Ficus luschnathiana Ficus schumacheri Ficus coerulescens Ficus popenoei Ficus gomelleira Ficus obtusifolia Ficus nymphaeifolia Ficus pertusa Ficus broadwayi Ficus subandina Ficus paraensis Ficus costaricana Ficus velutina Ficus crocata Ficus boliviana Ficus colubrinae Ficus calimana Ficus eximia Ficus casapiensis Ficus americana subsp. guianensis Ficus albert-smithii Ficus caballina Ficus aurea Ficus abutilifolia Ficus stuhlmannii Ficus thonningii Ficus lingua Ficus natalensis Ficus amadiensis Ficus reflexa Ficus cyathistipula Ficus scassellatii Ficus barteri Ficus sagittifolia Ficus lyrata Ficus preussii Ficus cyathistipuloides Ficus tesselata Ficus densistipulata Ficus trichopoda Ficus sansibarica Ficus trigonata Ficus ampana Ficus antandronarum Ficus humbertii Ficus marmorata Ficus rumphii Ficus mollis Ficus menabeensis Ficus curtipes Ficus crassiramea Ficus balete Ficus sundaica Ficus callophylla Ficus forstenii Ficus xylophylla Ficus consociata Ficus retusa Ficus lowii Ficus maclellandii Ficus benjamina Ficus subcordata Ficus archboldiana Ficus cordatula Ficus drupacea Ficus cucurbitina Ficus altissima Ficus kerkhovenii Ficus microcarpa Ficus glaberrima Ficus globosa Ficus depressa Ficus nervosa Ficus obliqua Ficus brachypoda Ficus destruens Ficus macrophylla Ficus rubiginosa Ficus platypoda Ficus watkinsiana Ficus glandifera Ficus xylosycia Ficus sterrocarpa Ficus hesperidiiformis Ficus verruculosa Ficus crassinervia Ficus densifolia Ficus religiosa Ficus caulocarpa Ficus virens Ficus ingens Ficus orthoneura Ficus apollinaris Ficus yoponensis Ficus segoviae Ficus insipida Ficus crassivenosa Ficus lapathifolia Ficus macbridei Ficus tonduzii Ficus mutisii Ficus crassiuscula Broussonetia greveana Broussonetia kurzii Broussonetia luzonica Broussonetia papyrifera Broussonetia kazinoki Trophis scandens Bleekrodea madagascariensis Sloetia elongata Sloetiopsis usambarensis Treculia acuminata Treculia obovoidea Treculia africana Brosimum sprucei Brosimum oligandrum Brosimum amazonicum Brosimum rubescens Brosimum utile Brosimum multinervium Brosimum potabile Brosimum parinarioides Brosimum longifolium Brosimum lactescens Brosimum guianense Brosimum gaudichaudii Brosimum glaucum Brosimum alicastrum subsp. bolivarense Brosimum alicastrum Brosimum acutifolium Brosimum costaricanum Trilepisium madagascariense Bosqueiopsis gilletii Utsetela neglecta Utsetela gabonensis Hijmania alta Dorstenia mannii Hijmania turbinata Dorstenia holstii Dorstenia tayloriana var. tayloriana Dorstenia brownii Dorstenia tenera Dorstenia ciliata Dorstenia poinsettiifolia Dorstenia yambuyaensis Dorstenia variifolia Dorstenia psilurus Dorstenia soerensenii Dorstenia urceolata Dorstenia bonijesu Dorstenia strangii Dorstenia tentaculata Dorstenia ramosa Dorstenia cayapia subsp. vitifolia Dorstenia lagoensis Dorstenia milaneziana Dorstenia bahiensis Dorstenia tubicina Dorstenia brasiliensis Dorstenia cayapia subsp. cayapia Dorstenia tenuis Dorstenia carautae Dorstenia hirta Dorstenia roigii Dorstenia caimitensis Dorstenia petraea Dorstenia fawcettii Dorstenia flagellifera Dorstenia erythrandra Dorstenia peruviana Dorstenia umbricola Dorstenia turnerifolia Dorstenia contrajerva Dorstenia drakena Dorstenia lindeniana Dorstenia excentrica Dorstenia appendiculata Dorstenia elliptica Dorstenia picta Dorstenia hildebrandtii var. schlechteri Dorstenia zanzibarica Dorstenia goetzei Dorstenia warneckei Dorstenia buchananii Dorstenia foetida Dorstenia benguellensis Dorstenia astyanactis Dorstenia barnimiana Dorstenia indica Dorstenia oligogyna Dorstenia djettii Dorstenia kameruniana Hijmania angusticornis Dorstenia africana Scyphosyce pandurata Scyphosyce manniana Fatoua villosa Fatoua pilosa Parartocarpus bracteatus Parartocarpus venenosus Hullettia griffithiana Hullettia dumosa Pseudostreblus indicus Maclura tinctoria subsp. mora Maclura tinctoria subsp. tinctoria Maclura spinosa Maclura andamanica Maclura africana Maclura thorelii Maclura tricuspidata Maclura pubescens Maclura cochinchinensis Maclura amboinensis Maclura fruticosa Maclura brasiliensis Maclura pomifera Artocarpus altissimus Artocarpus sepicanus Artocarpus montanus Artocarpus corneri Artocarpus scortechinii Artocarpus elasticus Artocarpus jarrettiae Artocarpus maingayi Artocarpus kemando Artocarpus sumatranus Artocarpus teysmannii Artocarpus sericicarpus Artocarpus tamaran Artocarpus excelsus Artocarpus lowii Artocarpus obtusus Artocarpus altilis Artocarpus camansi Artocarpus bergii Artocarpus horridus Artocarpus mariannensis Artocarpus treculianus Artocarpus blancoi Artocarpus pinnatisectus Artocarpus nobilis Artocarpus chama Artocarpus odoratissimus Artocarpus hispidus Artocarpus rigidus Artocarpus calophyllus Artocarpus melinoxylus Artocarpus hirsutus Artocarpus brevipedunculatus Artocarpus sarawakensis Artocarpus anisophyllus Artocarpus clementis Artocarpus heterophyllus Artocarpus integer Artocarpus annulatus Artocarpus rubrosoccatus Artocarpus vrieseanus var. refractus Artocarpus vriesianus var. vriesianus Artocarpus xanthocarpus Artocarpus tomentosulus Artocarpus primackii Artocarpus fretessii Artocarpus nitidus subsp. borneensis Artocarpus longifolius subsp. adpressus Artocarpus lamellosus Artocarpus rubrovenius Artocarpus subrotundifolius Artocarpus ovatus Artocarpus fulvicortex Artocarpus glaucus Artocarpus lacucha Artocarpus zeylanicus Artocarpus parvus Artocarpus nitidus subsp. humilis Artocarpus griffithii Artocarpus dadah Artocarpus gomezianus Artocarpus thailandicus Artocarpus hypargyreus Artocarpus styracifolius Artocarpus gongshanensis Artocarpus pithecogallus Artocarpus petelotii Artocarpus tonkinensis Artocarpus frutescens Artocarpus papuanus Prainea limpato Batocarpus amazonicus Batocarpus costaricensis Batocarpus orinocensis Clarisia biflora Clarisia racemosa Clarisia ilicifolia Taxotrophis macrophylla Taxotrophis ilicifolia Taxotrophis spinosa Taxotrophis taxoides Taxotrophis zeylanica Trophis montana Maillardia borbonica Afromorus mesozygia Milicia excelsa Milicia regia Ampalis dimepate Ampalis mauritiana Paratrophis insignis Paratrophis microphylla Paratrophis anthropophagorum Paratrophis glabra Paratrophis australiana Paratrophis philippinensis Paratrophis pendulina Sorocea duckei Sorocea sprucei subsp. saxicola Sorocea subumbellata Sorocea jaramilloi Sorocea pubivena subsp. hirtella Sorocea briquetii Sorocea muriculata subsp. muriculata Sorocea bonplandii Sorocea hilarii Sorocea guilleminiana Sorocea steinbachii Sorocea muriculata subsp. uaupensis Sorocea pubivena subsp. pubivena Sorocea pubivena subsp. oligotricha Sorocea trophoides Sorocea affinis Bagassa guianensis Trophis racemosa Trophis mexicana Trophis cuspidata Trophis involucrata Morus notabilis Morus celtidifolia Morus rubra Morus macroura Morus alba Morus mongolica Morus cathayana Morus kagayamae Morus nigra Morus australis Morus serrata Urtica urens Poikilospermum nobile Myriocarpa obovata Procris repens Elatostema retrohirtum Pilea longicaulis Leucosyke capitellata Pouzolzia zeylanica Boehmeria nivea Oreocnide trinervis Parietaria judaica Cecropia ficifolia
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